Iquitos está emplazado a aproximadamente 3,360 km (2,088 mi) de la desembocadura del Amazonas en el
océano Atlántico y a 125 km (77.67 mi) aguas abajo de la confluencia de los ríos
Ucayali y
Marañón, donde el cauce toma el nombre de Amazonas y a más de 3000 km (1,864 mi) de su fuente geográfica en ubicada en la
región Arequipa, al sur del Perú.
El área metropolitana de Iquitos se expande dentro de 4 distritos de la provincia de Maynas: Iquitos (159,023 habitantes), Belén (102,076 habitantes), Punchana (76,435 habitantes) y San Juan Bautista (68,806 habitantes).
Estando cerca de la línea ecuatorial, Iquitos posee un clima tropical lluvioso, con temperaturas que van desde los 15 °C a 31 °C. La temperatura promedio anual de Iquitos es 23 °C, con una humedad relativa promedio del 115%. La temporada de lluvia es de noviembre a mayo, con la red fluvial en su punto más alto en mayo y su nivel más bajo en octubre.
Iquitos se ha consolidado como la ciudad de mayor importancia en la Amazonía peruana y la sexta ciudad del Perú. Cuenta con universidades públicas y privadas, varios institutos técnicos, un moderno aeropuerto internacional, puertos fluviales y una carretera que une Iquitos con la ciudad de
Nauta. Es sede del
Vicariato Apostólico de Iquitos.7